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ContigExpress(序列拼接結(jié)果驗(yàn)證工具)

v3.0.0 綠色版

ContigExpress(序列拼接結(jié)果驗(yàn)證工具)
  • 軟件大小：1.0M
  • 軟件語(yǔ)言：中文
  • 軟件類型：國(guó)產(chǎn)軟件 / 其他行業(yè)
  • 軟件授權(quán)：免費(fèi)軟件
  • 更新時(shí)間：2016-12-21 10:20
  • 軟件等級(jí)：4星
  • 應(yīng)用平臺(tái)：WinAll, WinXP
  • 軟件官網(wǎng)：

ITMOP本地下載文件大小：1.0M

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小編為您推薦：ContigExpress序列拼接

ContigExpress是一款專業(yè)的測(cè)序結(jié)果的序列拼接軟件,是可以幫助生物研究的朋友們更加方便的測(cè)量序列.有需要的朋友就來(lái)IT貓撲下載吧!

軟件簡(jiǎn)介

由于一般測(cè)序方法的限制，測(cè)續(xù)結(jié)果一般只能到800bp左右，所以對(duì)于較長(zhǎng)片段只能用不同引物測(cè)序后根據(jù)結(jié)果拼接，ContigExpress正是一款非常實(shí)用的序列拼接軟件。

使用方法

解壓縮下載的壓縮文件contig.zip文件，保證文件CExpress.exe,Gexudat.def在同一個(gè)目錄下，打開(kāi)Cexpress.exe應(yīng)用程序，進(jìn)入ContigExpress操作界面

ContigExpress

點(diǎn)擊菜單上的“project”選擇“Add Fragments”，一般我們發(fā)給您的是AB1文件，如果您有其它格式的文件，也可以選擇，在這里我們選擇AB1文件，以其為例

ContigExpress

選擇您存放AB1文件（即我們Email給您的測(cè)序結(jié)果的彩圖文件）的目錄，選擇文件類型為ALL FILES, 之后打開(kāi)要拼接的AB1，從而添加進(jìn)ContigExpress軟件。在此以A、B兩個(gè)序列為例，如果有多個(gè)序列的也可以同時(shí)添加進(jìn)入。

ContigExpress

選中要拼接的序列，再選菜單 “Assemble”欄下的“Assemble Selected Fragments”命令，或用工具欄上的按鈕，如圖3。若兩個(gè)結(jié)果能夠拼接起來(lái)的，會(huì)得到一個(gè)Assemble1下的contig1的結(jié)果

ContigExpress

雙擊contig1，打開(kāi)拼接后的結(jié)果，選中菜單“VIEW”欄，進(jìn)入VIEW OPTION，將SHOW ALIGNMENT AS 由 TEXT 改為 GRAPH.，點(diǎn)擊OK后得到結(jié)果如圖5。此時(shí)可能會(huì)因?yàn)閮蓷l序列的測(cè)序結(jié)果誤差，會(huì)有不同的地方，在拼接圖片框中的綠色豎杠就表示了這些不同的地方。接著可點(diǎn)擊綠色豎杠找到有誤差的地方，進(jìn)行修改。

ContigExpress

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